A presente proposta objetiva o estudo do Sistema Estuarino de Santos-São Vicente (SP) a partir de uma perspectiva ecossistêmica, visando reconhecer as mudanças na diversidade dos recursos e na estrutura trófica do sistema exposto a modificações antrópicas ao longo do tempo, quer seja por ações naturais ou aquelas induzidas pela ocupação humana. As hipóteses a serem testadas são quanto a eventuais modificações na composição e na abundância e na estrutura trófica desse sistema ao longo do período. O trabalho será conduzido a partir de um conjunto de dados composto por dados primários e secundários disponíveis, restando apenas complementação quanto a aspectos abióticos e de a estimativa de alguns parâmetros populacionais (estrato da população e alimentação) de espécies secundárias na pesca. O modelo a ser aplicado permite a realização de avaliações preditivas de modo a orientar tomadas de decisão em função dos riscos advindos da ampliação da pressão pesqueira como de incidentes no estuário. Os resultados poderão subsidiar melhor adequação do manejo e ordenamento do uso deste ambiente pelo compartimento da pesca, bem como a interação com os demais serviços ambientais, possibilitando a visualização de cenários futuros frente aos possíveis impactos negativos causados pelas ações antrópicas neste ambiente (acidentes ambientais, expansões portuárias, ocupação urbana, exploração dos recursos naturais etc.).